Para la nueva temporada en Primera, Flores seguiría al frente del banquillo. De forma excepcional y transitoria, en esta temporada y la siguiente la Primera División constó de veintidós clubes participantes, todos ellos integrados en un grupo único. En la siguiente temporada, la 2007-2008, en su debut en la Regional Preferente de Almería, logró acabar en una meritoria sexta posición, camiseta alemania 2022 sin embargo desde la conclusión de dicha temporada en el año 2008 no ha vuelto a competir más.
